《行政处罚法》第六条第二款规定：“公民、法人或者其他组织因行政机关违法给予行政处罚受到损害的，有权依法提出赔偿要求。”

根据上述规定，企业因为环保问题被违法拆除后，当然可以申请国家赔偿。